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Target id: 1637
Nomenclature: MMP13
Family: M10: Matrix metallopeptidase
This target is also described as a ligand entry: matrix metalloproteinase 13
Gene and Protein Information | ||||||
Species | TM | AA | Chromosomal Location | Gene Symbol | Gene Name | Reference |
Human | - | 471 | 11q22.2 | MMP13 | matrix metallopeptidase 13 | |
Mouse | - | 472 | 9 A1 | Mmp13 | matrix metallopeptidase 13 | |
Rat | - | 466 | 8q11 | Mmp13 | matrix metallopeptidase 13 |
Previous and Unofficial Names |
UMRCASE | interstitial collagenase | Mmp1 | CLG3 | collagenase-1 | matrix metallopeptidase 13 (collagenase 3) |
Database Links | |
Specialist databases | |
MEROPS | M10.013 (Hs) |
Other databases | |
Alphafold | P45452 (Hs), P33435 (Mm), P23097 (Rn) |
BRENDA | 3.4.24.- |
CATH/Gene3D | 3.40.390.10, 2.110.10.10 |
ChEMBL Target | CHEMBL280 (Hs), CHEMBL3638350 (Mm), CHEMBL4944 (Rn) |
DrugBank Target | P45452 (Hs), P45452 (Hs) |
Ensembl Gene | ENSG00000137745 (Hs), ENSMUSG00000050578 (Mm), ENSRNOG00000008478 (Rn) |
Entrez Gene | 4322 (Hs), 17386 (Mm), 171052 (Rn) |
Human Protein Atlas | ENSG00000137745 (Hs) |
KEGG Enzyme | 3.4.24.- |
KEGG Gene | hsa:4322 (Hs), mmu:17386 (Mm), rno:171052 (Rn) |
OMIM | 600108 (Hs) |
Orphanet | ORPHA123436 (Hs) |
Pharos | P45452 (Hs) |
RefSeq Nucleotide | NM_002427 (Hs), NM_008607 (Mm), NM_133530 (Rn) |
RefSeq Protein | NP_002418 (Hs), NP_032633 (Mm), NP_598214 (Rn) |
SynPHARM |
82515 (in complex with compound 15 [PMID: 22017539]) 78451 (in complex with compound 1 [PMID: 17935984]) |
UniProtKB | P45452 (Hs), P33435 (Mm), P23097 (Rn) |
Wikipedia | MMP13 (Hs) |
Enzyme Reaction | ||||
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Download all structure-activity data for this target as a CSV file
Inhibitors | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Inhibitor Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SL422 is a broad-spectrum inhibitor of MMP enzymes [15]. |
Immunopharmacology Comments |
Elevated MMP13 expression correlates with inflammation in patients with Crohn's disease and ulcerative colitis, suggesting a role for this protease in disease pathogenesis [14]. Inhibition of MMP13's preferential degradation of type II collagen and aggrecan is predicted to prevent/reduce the destruction of cartilage in rheumatoid arthritis [7,16]. |
Immuno Disease Associations | ||||||||||
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Clinically-Relevant Mutations and Pathophysiology | ||||||||||||||
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1. Abbenante G, Fairlie DP. (2005) Protease inhibitors in the clinic. Med Chem, 1 (1): 71-104. [PMID:16789888]
2. Buchler A, Ismailani US, MacMullin N, Abdirahman F, Adi M, Bi C, Jany C, Keillor JW, Rotstein BH. (2023) Quinazoline-2-Carboxamides as Selective PET Radiotracers for Matrix Metalloproteinase-13 Imaging in Atherosclerosis. J Med Chem, 66 (10): 6682-6696. [PMID:37158732]
3. Buchler A, Munch M, Farber G, Zhao X, Al-Haddad R, Farber E, Rotstein BH. (2022) Selective Imaging of Matrix Metalloproteinase-13 to Detect Extracellular Matrix Remodeling in Atherosclerotic Lesions. Mol Imaging Biol, 24 (1): 93-103. [PMID:34231104]
4. Chen JM, Nelson FC, Levin JI, Mobilio D, Moy FJ, Nilakantan R, Zask A, Powers R. (2000) Structure-Based Design of a Novel, Potent, and Selective Inhibitor for MMP-13 Utilizing NMR Spectroscopy and Computer-Aided Molecular Design. J Am Chem Soc, 122 (40): 9648-9654. DOI: 10.1021/ja001547g
5. Fray MJ, Dickinson RP, Huggins JP, Occleston NL. (2003) A potent, selective inhibitor of matrix metalloproteinase-3 for the topical treatment of chronic dermal ulcers. J Med Chem, 46 (16): 3514-25. [PMID:12877590]
6. Freeman-Cook KD, Reiter LA, Noe MC, Antipas AS, Danley DE, Datta K, Downs JT, Eisenbeis S, Eskra JD, Garmene DJ et al.. (2007) Potent, selective spiropyrrolidine pyrimidinetrione inhibitors of MMP-13. Bioorg Med Chem Lett, 17 (23): 6529-34. [PMID:17935984]
7. Konttinen YT, Ainola M, Valleala H, Ma J, Ida H, Mandelin J, Kinne RW, Santavirta S, Sorsa T, López-Otín C et al.. (1999) Analysis of 16 different matrix metalloproteinases (MMP-1 to MMP-20) in the synovial membrane: different profiles in trauma and rheumatoid arthritis. Ann Rheum Dis, 58 (11): 691-7. [PMID:10531073]
8. Levin JI, Chen JM, Laakso LM, Du M, Schmid J, Xu W, Cummons T, Xu J, Jin G, Barone D et al.. (2006) Acetylenic TACE inhibitors. Part 3: Thiomorpholine sulfonamide hydroxamates. Bioorg Med Chem Lett, 16 (6): 1605-9. [PMID:16426848]
9. MRC. AZD6605 Matrix metallopeptidase 13 (MMP13) inhibitor. Accessed on 28/10/2014. Modified on 28/10/2014. MRC/AstraZeneca: Mechanisms of Disease Call, http://webarchive.nationalarchives.gov.uk/20120104105854/http://www.mrc.ac.uk/consumption/groups/public/documents/content/mrc008371.pdf
10. Ruminski PG, Massa M, Strohbach J, Hanau CE, Schmidt M, Scholten JA, Fletcher TR, Hamper BC, Carroll JN, Shieh HS et al.. (2016) Discovery of N-(4-Fluoro-3-methoxybenzyl)-6-(2-(((2S,5R)-5-(hydroxymethyl)-1,4-dioxan-2-yl)methyl)-2H-tetrazol-5-yl)-2-methylpyrimidine-4-carboxamide. A Highly Selective and Orally Bioavailable Matrix Metalloproteinase-13 Inhibitor for the Potential Treatment of Osteoarthritis. J Med Chem, 59 (1): 313-27. [PMID:26653735]
11. Takeuchi T, Hayashi M, Tamita T, Nomura Y, Kojima N, Mitani A, Takeda T, Hitaka K, Kato Y, Kamitani M et al.. (2022) Discovery of Aryloxyphenyl-Heptapeptide Hybrids as Potent and Selective Matrix Metalloproteinase-2 Inhibitors for the Treatment of Idiopathic Pulmonary Fibrosis. J Med Chem, 65 (12): 8493-8510. [PMID:35687819]
12. Taylor SJ, Abeywardane A, Liang S, Muegge I, Padyana AK, Xiong Z, Hill-Drzewi M, Farmer B, Li X, Collins B et al.. (2011) Fragment-based discovery of indole inhibitors of matrix metalloproteinase-13. J Med Chem, 54 (23): 8174-87. [PMID:22017539]
13. Troeberg L, Nagase H. (2012) Proteases involved in cartilage matrix degradation in osteoarthritis. Biochim Biophys Acta, 1824 (1): 133-45. [PMID:21777704]
14. Vizoso FJ, González LO, Corte MD, Corte MG, Bongera M, Martínez A, Martín A, Andicoechea A, Gava RR. (2006) Collagenase-3 (MMP-13) expression by inflamed mucosa in inflammatory bowel disease. Scand J Gastroenterol, 41 (9): 1050-5. [PMID:16938718]
15. Xue CB, Voss ME, Nelson DJ, Duan JJ, Cherney RJ, Jacobson IC, He X, Roderick J, Chen L, Corbett RL et al.. (2001) Design, synthesis, and structure-activity relationships of macrocyclic hydroxamic acids that inhibit tumor necrosis factor alpha release in vitro and in vivo. J Med Chem, 44 (16): 2636-60. [PMID:11472217]
16. Yoshihara Y, Nakamura H, Obata K, Yamada H, Hayakawa T, Fujikawa K, Okada Y. (2000) Matrix metalloproteinases and tissue inhibitors of metalloproteinases in synovial fluids from patients with rheumatoid arthritis or osteoarthritis. Ann Rheum Dis, 59 (6): 455-61. [PMID:10834863]
M10: Matrix metallopeptidase: MMP13. Last modified on 10/05/2023. Accessed on 04/12/2024. IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY, https://www.guidetomalariapharmacology.org/GRAC/ObjectDisplayForward?objectId=1637.